Çok sayıda Jedi kendi klon askerleri tarafından alt edildi. Emir 66 dan kurtulabilecek kadar şanslı ya da yetenekli olanlar, kendilerini en karanlık soruyla yüzleşmiş durumda buldular. Korumaya and içtikleri Cumhuriyeti kurtarmak için artık çok mu geçti?
Oyunun Sonu
Bazı Jedi'lar yiğitçe bir son direnişe girişecekler. Diğerleri kendilerine ihanet etmiş olan galaksiye sırtlarını dönerek yeraltının gölgelerine sığınacaklar. Yine de kimileri ezilenlere özgürlük getirme çabalarına devam etmeyi deneyecekler. Ve kararlı birkaçından oluşan bir grup bir araya gelerek Sith hükmünü devirmek amacıyla İmparator'un yeni demir yumruğu için bir tuzak hazırlayacaklar -- Darth Vader için.